More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0017 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  100 
 
 
407 aa  839    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  28.18 
 
 
338 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
1276 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  26.37 
 
 
482 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.19 
 
 
730 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
927 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.34 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.79 
 
 
1694 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.69 
 
 
1007 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.19 
 
 
576 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
280 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 
707 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  20.42 
 
 
512 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
562 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.82 
 
 
1979 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  28.7 
 
 
306 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
543 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3140  putative serine protease protein  28.57 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3418  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.7 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
878 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.69 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
1827 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
1049 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
3035 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
732 aa  76.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
564 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.31 
 
 
784 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
761 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
711 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.31 
 
 
818 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.77 
 
 
635 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 
836 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  29.09 
 
 
661 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.04 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.08 
 
 
810 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.34 
 
 
743 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  31.71 
 
 
1101 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.14 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.49 
 
 
784 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
4079 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
1297 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
716 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
207 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
652 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 
652 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
4489 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
250 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
3560 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.57 
 
 
581 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.17 
 
 
560 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.04 
 
 
714 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.08 
 
 
1022 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
1005 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
1034 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
699 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.67 
 
 
1138 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
1192 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
2240 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.57 
 
 
887 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
652 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  30.94 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.63 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  36.7 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 
519 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
1094 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.83 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 
632 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.29 
 
 
746 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
361 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
833 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
762 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
988 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 
174 aa  66.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.81 
 
 
582 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.63 
 
 
623 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
1276 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
523 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
279 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
565 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 
237 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>