48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NmulC_2781 on replicon NC_007616
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  62.33 
 
 
295 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  62.33 
 
 
295 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  62.33 
 
 
295 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  44.96 
 
 
282 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  38.19 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  38.02 
 
 
289 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  34.01 
 
 
292 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  33.1 
 
 
307 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  33.58 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  29.58 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  34.67 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  30.48 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1566  hypothetical protein  49.21 
 
 
130 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902821  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  27.4 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  25.62 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  28.12 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  32 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  25.37 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.06 
 
 
188 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  28.46 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  32.76 
 
 
216 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  36.54 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  32.76 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  32.76 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5594  hypothetical protein  32.56 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  23.33 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  29.92 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  26.67 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  26.67 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  32.18 
 
 
359 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  27.95 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  27.95 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  41.43 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  32.18 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  25.51 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  34.67 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  27.91 
 
 
182 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  32.56 
 
 
169 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  30.25 
 
 
173 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  43.55 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  35.16 
 
 
357 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  37.8 
 
 
147 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  29.36 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  29.2 
 
 
401 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  31.13 
 
 
399 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>