219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1781 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  100 
 
 
180 aa  357  6e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  37.71 
 
 
181 aa  134  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  40.22 
 
 
187 aa  129  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  35.52 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 
187 aa  111  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 
186 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 
179 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 
194 aa  106  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  34.25 
 
 
187 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 
174 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  36.72 
 
 
173 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 
174 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 
180 aa  100  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  34.07 
 
 
183 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 
174 aa  100  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.61 
 
 
184 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 
192 aa  98.2  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  29.24 
 
 
184 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  36.09 
 
 
179 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 
190 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 
187 aa  89  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  35.34 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 
187 aa  89  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 
186 aa  88.2  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  29.44 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  33.79 
 
 
154 aa  87.8  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 
193 aa  87.8  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 
195 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.55 
 
 
193 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  35.38 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  30.68 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  36.81 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.48 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  28.57 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  34.01 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.04 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  28.02 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  32.6 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  29.31 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  26.37 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  25.14 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  32.06 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  23.84 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  28.77 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.67 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  32.48 
 
 
271 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.37 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  31.21 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  30 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  27.5 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  30 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  26.9 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  27.27 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  32.61 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  29.22 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  28.33 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  30.66 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  30.66 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.66 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  26.32 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  30.66 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  30.66 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>