More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1766 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  100 
 
 		 591 aa  1197    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  36.13 
 
 		 574 aa  335  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 598 aa  93.6  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2079  putative sensor with HAMP domain protein  26.82 
 
 		 509 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1362 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 699 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  28.25 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  27.01 
 
 		 1361 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.34 
 
 		 1029 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.89 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.46 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  20.82 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 		 819 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 699 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  23.74 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.36 
 
 		 1356 aa  70.5  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  21.79 
 
 		 695 aa  70.5  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1076  sensor protein  36.73 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  28.14 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  26.14 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.4 
 
 		 1212 aa  67.8  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  22.91 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  24.8 
 
 		 483 aa  67  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  21.66 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  28.72 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  26.64 
 
 		 612 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  25.9 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  22.08 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  27.53 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  23.19 
 
 		 1153 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  23.19 
 
 		 1153 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  22.47 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  24.38 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  24.32 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.54 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  23.64 
 
 		 1374 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.32 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  20.96 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  22.38 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  26.75 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 788 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  22.38 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  28.95 
 
 		 626 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.18 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.06 
 
 		 1468 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.79 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0242034  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  35 
 
 		 455 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  35 
 
 		 455 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.46 
 
 		 788 aa  57  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 581 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 590 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 597 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 1877 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 		 348 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.24 
 
 		 681 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 915 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 		 1046 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 565 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.74 
 
 		 879 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  21.84 
 
 		 611 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  24.82 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 679 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 690 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 		 817 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  21.97 
 
 		 744 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  25.35 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 773 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.21 
 
 		 662 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.92 
 
 		 772 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 487 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 		 641 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 		 1198 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 597 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  21.96 
 
 		 643 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  20.48 
 
 		 810 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 607 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  22.65 
 
 		 670 aa  54.7  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  23.84 
 
 		 608 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  28.69 
 
 		 696 aa  54.3  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  23.6 
 
 		 346 aa  53.9  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  38.71 
 
 		 589 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  31.76 
 
 		 554 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30 
 
 		 1142 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 496 aa  53.9  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  24.37 
 
 		 726 aa  53.9  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  25.76 
 
 		 758 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 829 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 692 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30 
 
 		 1142 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>