171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1728 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  48.24 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  49.49 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  42.71 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  44.16 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  40.59 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  47.67 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  46.27 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  40.2 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  47.89 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  43.94 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  43.15 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  38.5 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  39.7 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  39.13 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  40.72 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  39.29 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  38.19 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  38.19 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  38.38 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  40.43 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  38.78 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  39.7 
 
 		 203 aa  148  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  37.37 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  39.6 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  38.69 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  36.18 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  35.11 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.36 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.68 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.9 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.68 
 
 		 243 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.2 
 
 		 243 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  33.33 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  31.28 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  41.95 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  35.75 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  31.96 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  32.63 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  31.73 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  32.11 
 
 		 297 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  32.97 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.63 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  29.65 
 
 		 303 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  36.47 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  31.15 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  32.54 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.98 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  35.29 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  32.97 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.73 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.8 
 
 		 232 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  35.88 
 
 		 259 aa  95.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  29.11 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  32.09 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  34.71 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  31.37 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  30.56 
 
 		 245 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  33.33 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  32.84 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.71 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  29.47 
 
 		 268 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.19 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  28.65 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  32.51 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  28.09 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  34.1 
 
 		 263 aa  85.9  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  28.86 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  27.1 
 
 		 257 aa  85.1  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  27.46 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  30.29 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  32.4 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  29.21 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  31.76 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.98 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  28.42 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.64 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.07 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  28.44 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  31.38 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  31.05 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  25.13 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.49 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  28.71 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  34.13 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  26.44 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  30.05 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  28.16 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  28.23 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  29.19 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  25 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  26.09 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  25.79 
 
 		 278 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  24.47 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  27.05 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  27.18 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  27.92 
 
 		 235 aa  72  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>