39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1610 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.69 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  31.82 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.39 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 316 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  28.31 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  34.31 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  31.39 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.71 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  30.11 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.56 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.94 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.16 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.06 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.2 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  26.29 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.3 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.14 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.59 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.59 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  28.86 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  30.5 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 		 406 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  36.78 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.46 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  31.46 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  18.6 
 
 		 437 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2399  hypothetical protein  23.64 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0283392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>