39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1610 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.75 
 
 
184 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.69 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  31.82 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.98 
 
 
316 aa  81.6  5e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.39 
 
 
187 aa  82  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55045e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.28 
 
 
185 aa  80.5  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  28.31 
 
 
183 aa  80.5  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  34.31 
 
 
184 aa  79  4e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  31.39 
 
 
188 aa  78.6  5e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.88 
 
 
179 aa  76.6  2e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.71 
 
 
183 aa  76.3  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  30.11 
 
 
201 aa  75.5  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 
177 aa  75.1  5e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.43 
 
 
202 aa  74.7  6e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.56 
 
 
202 aa  74.7  8e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
180 aa  74.3  1e-12  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.16 
 
 
182 aa  72.8  2e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.94 
 
 
202 aa  73.6  2e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.06 
 
 
182 aa  66.2  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.2 
 
 
182 aa  65.9  4e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  26.29 
 
 
188 aa  63.9  1e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.3 
 
 
176 aa  62.4  4e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.14 
 
 
184 aa  58.5  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
182 aa  57.4  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.59 
 
 
185 aa  57.4  1e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.59 
 
 
187 aa  56.6  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  28.86 
 
 
180 aa  54.7  8e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.01 
 
 
178 aa  53.5  2e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.97 
 
 
187 aa  53.5  2e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  30.5 
 
 
180 aa  53.1  2e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 
406 aa  48.5  5e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  48.1  7e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.15 
 
 
232 aa  48.1  7e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  36.78 
 
 
148 aa  47.8  8e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.46 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.41236e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  31.46 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  18.6 
 
 
437 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  6.3148e-08 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2399  hypothetical protein  23.64 
 
 
224 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0283392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>