26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1607 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  100 
 
 		 171 aa  354  3.9999999999999996e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.97 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.36 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  36.64 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.12 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.13 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  32.12 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.9 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  30.22 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  30.14 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  30.22 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  37.84 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  30.63 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  30.22 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.12 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.76 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.03 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.95 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  28.19 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.54 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.17 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.87 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.97 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  36.73 
 
 		 1201 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.84 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  23.57 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>