27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1603 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  27.63 
 
 		 606 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  33.79 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  34.27 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  31.58 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  32.3 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  37.33 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.5 
 
 		 649 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  30.38 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  29.05 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  29.85 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  32.12 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  29.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  32.43 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  31.93 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.4 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  32.85 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  26.58 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  30.95 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.33 
 
 		 649 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  29.01 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  29.33 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.17 
 
 		 649 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.33 
 
 		 649 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>