More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1539 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
421 aa  867    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  37.03 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 
430 aa  270  5e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 
421 aa  265  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 
422 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
422 aa  259  7e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  35.36 
 
 
411 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.43 
 
 
432 aa  243  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 
411 aa  239  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  35 
 
 
397 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
433 aa  229  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
414 aa  229  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
411 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
429 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 
432 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.08 
 
 
410 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
433 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
433 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
433 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
426 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
639 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  31.04 
 
 
635 aa  200  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 
636 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  32.37 
 
 
636 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.51 
 
 
636 aa  196  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
630 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
635 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
630 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
635 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
642 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  31.92 
 
 
637 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
635 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
635 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
635 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
422 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 
640 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
422 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.48 
 
 
644 aa  186  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
640 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
634 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
635 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  30.51 
 
 
629 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
639 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.75 
 
 
635 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
641 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.87 
 
 
644 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
641 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.13 
 
 
647 aa  176  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
821 aa  176  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.39 
 
 
543 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
468 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
634 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
464 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
465 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
455 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
634 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
515 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
464 aa  166  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.38 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
646 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 
468 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
536 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.68 
 
 
465 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
451 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
447 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 
830 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  26.93 
 
 
454 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
462 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.78 
 
 
540 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
467 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 
464 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.87 
 
 
455 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
522 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
454 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
454 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.33 
 
 
471 aa  159  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  27.77 
 
 
469 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  29.35 
 
 
453 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  27.84 
 
 
535 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  29.36 
 
 
484 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
470 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  27.19 
 
 
452 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 
468 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 
468 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
454 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 
454 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  28.23 
 
 
454 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  27.64 
 
 
452 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
535 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>