54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1528 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  100 
 
 
792 aa  1535  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.53148e-09 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  52.52 
 
 
722 aa  578  1e-163  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.97915e-10 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  52.39 
 
 
722 aa  565  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.58397e-09 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  47.17 
 
 
1987 aa  140  9e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  53.72 
 
 
637 aa  136  1e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.7 
 
 
440 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  40 
 
 
671 aa  119  2e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  49.38 
 
 
490 aa  115  4e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  43.16 
 
 
623 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  46.98 
 
 
374 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  50.44 
 
 
458 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  48.89 
 
 
1755 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.94 
 
 
478 aa  84.7  6e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 
487 aa  79  3e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.68 
 
 
320 aa  78.6  4e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.74 
 
 
447 aa  77.4  9e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.85785e-13  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.36 
 
 
420 aa  75.9  3e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 
386 aa  71.6  5e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.54 
 
 
412 aa  70.9  9e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 
386 aa  70.5  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  39.1 
 
 
259 aa  70.5  1e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.31 
 
 
417 aa  67  1e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.06 
 
 
456 aa  65.5  4e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  31.93 
 
 
6109 aa  65.5  4e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.49 
 
 
319 aa  65.1  5e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  6.51702e-11  n/a   
 
 
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.64 
 
 
429 aa  63.9  1e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.13 
 
 
427 aa  63.9  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 
727 aa  61.6  5e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  30.13 
 
 
2074 aa  61.2  7e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
543 aa  59.3  3e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
544 aa  58.9  3e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 
428 aa  58.9  4e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.18101e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  42.59 
 
 
1707 aa  57.8  8e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.45 
 
 
542 aa  56.2  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  39.81 
 
 
290 aa  56.2  2e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  32.95 
 
 
1369 aa  56.2  2e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.82 
 
 
4357 aa  54.7  7e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  49.18 
 
 
342 aa  54.3  8e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  31.78 
 
 
292 aa  53.9  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 
506 aa  52.8  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.78 
 
 
402 aa  53.1  2e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 
322 aa  52.4  4e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  7.28339e-10  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  44.05 
 
 
1264 aa  51.2  7e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.24 
 
 
294 aa  50.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  34.81 
 
 
314 aa  50.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  35.62 
 
 
1335 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  39.18 
 
 
366 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  38.81 
 
 
780 aa  47.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  30.85 
 
 
8918 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  39.24 
 
 
380 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.68113e-11  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  42.22 
 
 
570 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
401 aa  45.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  39.73 
 
 
381 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  9.77039e-05  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  34.02 
 
 
3907 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>