135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1514 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 485 aa  1009    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  29.42 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 406 aa  100  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  24.95 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 395 aa  90.5  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  22.72 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 457 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  25.99 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.7 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  24.93 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  21.98 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 425 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.96 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  21.55 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.12 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.27 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.77 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  24.19 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.53 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 		 381 aa  57  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.75 
 
 		 382 aa  57  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  23.47 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.16 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  20.79 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  25 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  22.64 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  24.39 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  22.43 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  22.89 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  21.31 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 394 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 		 374 aa  50.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.63 
 
 		 386 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  24.16 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  24.46 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  20.1 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  22.13 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  21.56 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  22.19 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  19.42 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  22.22 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  24.88 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.12 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  25.89 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>