27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1430 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  248  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  41.38 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  41.94 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.46 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  40.32 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  46.15 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  44.23 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  38.3 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  44.23 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  40.43 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  38.71 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  40.38 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  48.08 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  38.46 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  41.3 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  38.46 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  40 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  46 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  38.46 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  32.69 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  40.43 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  37.74 
 
 		 95 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  42.55 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  35.85 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  37.5 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  39.22 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>