More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1385 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  100 
 
 
351 aa  723    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.82 
 
 
363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  43.1 
 
 
348 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  43.43 
 
 
348 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  45.53 
 
 
354 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.6 
 
 
364 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  46.15 
 
 
356 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.9 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.94 
 
 
371 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.64 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.07 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.92 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.48 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.19 
 
 
362 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.87 
 
 
356 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.31 
 
 
362 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.4 
 
 
361 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 
399 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.44 
 
 
362 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 
343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.97 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  46.5 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.55 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  42.53 
 
 
349 aa  271  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 
364 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.79 
 
 
341 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.47 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.24 
 
 
340 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.58 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.58 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  43.6 
 
 
408 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.24 
 
 
340 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  40.7 
 
 
357 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  42.18 
 
 
367 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 
371 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.5 
 
 
347 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  42 
 
 
345 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.27 
 
 
356 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.69 
 
 
351 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.11 
 
 
351 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.21 
 
 
347 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.48 
 
 
365 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.79 
 
 
348 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.73 
 
 
355 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.08 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.79 
 
 
359 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  41.69 
 
 
364 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.82 
 
 
356 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.06 
 
 
353 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.06 
 
 
380 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  41.47 
 
 
368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.74 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.28 
 
 
365 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.84 
 
 
421 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 
344 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  40.25 
 
 
344 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  40.25 
 
 
342 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 
367 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.6 
 
 
376 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  38.86 
 
 
357 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 
340 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  41.94 
 
 
388 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.2 
 
 
358 aa  250  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 
372 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.6 
 
 
365 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  38.89 
 
 
428 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.22 
 
 
358 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  41.79 
 
 
360 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  39.88 
 
 
377 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  40.36 
 
 
350 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  41.76 
 
 
369 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.78 
 
 
465 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.28 
 
 
370 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.78 
 
 
389 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.18 
 
 
430 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.38 
 
 
356 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.08 
 
 
368 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 
342 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.38 
 
 
356 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.31 
 
 
365 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.24 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.78 
 
 
368 aa  246  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.38 
 
 
356 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.24 
 
 
395 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  41.52 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.55 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  40.51 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 
374 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 
374 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 
374 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  43.18 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  41.31 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  38.75 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>