28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1353 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  64.25 
 
 
180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.67 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  27.61 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.58 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  28.39 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.79 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.86 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.32 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.68 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.87 
 
 
191 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.79 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.79 
 
 
183 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  31.48 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  27.93 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.81 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.18 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.5 
 
 
202 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.32 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  23.77 
 
 
437 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  25.71 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.15 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.17 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.46 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.22 
 
 
180 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.97 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  25.93 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>