More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1320 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
815 aa  1679  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  7.20865e-12 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.54 
 
 
744 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.71 
 
 
744 aa  435  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
744 aa  429  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.73 
 
 
756 aa  416  1e-115  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  3.1195e-05  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.9 
 
 
751 aa  419  1e-115  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.14 
 
 
744 aa  413  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.31 
 
 
739 aa  407  1e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 
740 aa  387  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
959 aa  304  4e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  29.9 
 
 
797 aa  289  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
768 aa  285  2e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.04 
 
 
962 aa  282  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.69 
 
 
1053 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.55 
 
 
972 aa  275  2e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.46 
 
 
773 aa  265  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  28.67 
 
 
751 aa  265  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.12 
 
 
764 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  27.24 
 
 
986 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.9 
 
 
762 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.61 
 
 
941 aa  257  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  27.83 
 
 
912 aa  253  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.11 
 
 
804 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
764 aa  250  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
815 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  28.09 
 
 
795 aa  245  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
973 aa  245  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.74 
 
 
764 aa  243  8e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.19 
 
 
805 aa  240  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
763 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.67 
 
 
753 aa  234  4e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.62 
 
 
752 aa  234  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.03 
 
 
761 aa  233  7e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  26.27 
 
 
865 aa  233  9e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.26 
 
 
815 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  25.47 
 
 
780 aa  231  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.24 
 
 
764 aa  229  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.35 
 
 
751 aa  229  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.06515e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  28.42 
 
 
761 aa  228  5e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 
738 aa  226  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  26.65 
 
 
795 aa  226  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.52 
 
 
1086 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.34 
 
 
807 aa  224  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  27.96 
 
 
764 aa  220  8e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  26.49 
 
 
771 aa  217  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.29 
 
 
781 aa  216  1e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.78 
 
 
775 aa  216  2e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.89 
 
 
803 aa  214  5e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.11055e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  25.63 
 
 
804 aa  214  6e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
778 aa  214  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  25.99 
 
 
831 aa  214  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.97 
 
 
808 aa  214  8e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.05 
 
 
806 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 
789 aa  212  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.04 
 
 
829 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.08 
 
 
855 aa  211  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.53 
 
 
868 aa  209  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  9.44502e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.64 
 
 
758 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.65 
 
 
812 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 
802 aa  207  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.13 
 
 
807 aa  207  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.1 
 
 
848 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.58 
 
 
759 aa  204  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.57 
 
 
790 aa  204  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
824 aa  202  2e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.91 
 
 
896 aa  202  2e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.53 
 
 
766 aa  202  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  25.2 
 
 
798 aa  199  1e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.54 
 
 
739 aa  200  1e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.26 
 
 
803 aa  200  1e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.51 
 
 
775 aa  200  1e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  25.49 
 
 
862 aa  199  2e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.54 
 
 
807 aa  199  2e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.51 
 
 
775 aa  199  2e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.51 
 
 
775 aa  199  2e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.97 
 
 
782 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  23.65 
 
 
815 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  23.33 
 
 
931 aa  191  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.13 
 
 
790 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.23 
 
 
861 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.14 
 
 
868 aa  176  1e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  23.37 
 
 
1210 aa  176  2e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  23.65 
 
 
758 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.95 
 
 
685 aa  166  2e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.16 
 
 
838 aa  160  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 
928 aa  160  9e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  3.00252e-12 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.19 
 
 
927 aa  159  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  2.20197e-08 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.9 
 
 
1198 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 
905 aa  155  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  30.42 
 
 
943 aa  154  6e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  27.96 
 
 
948 aa  154  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.68 
 
 
928 aa  154  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  24.11 
 
 
1178 aa  153  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
937 aa  152  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
914 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  28.72 
 
 
939 aa  149  2e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.72 
 
 
932 aa  148  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  30.25 
 
 
954 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.11 
 
 
897 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.6 
 
 
890 aa  144  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>