More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1310 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  39.47 
 
 
220 aa  151  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  41.41 
 
 
237 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  38.64 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  38.64 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  39.9 
 
 
229 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  36.16 
 
 
229 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  37.39 
 
 
236 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.5 
 
 
232 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  39.7 
 
 
230 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  38.54 
 
 
233 aa  138  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
231 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.25 
 
 
228 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.81 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.73 
 
 
234 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  38.66 
 
 
235 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  31.67 
 
 
241 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  34.98 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.03 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  34.2 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.12 
 
 
288 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  29.57 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 
236 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 
236 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  30.43 
 
 
236 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.77 
 
 
237 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
234 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  39.46 
 
 
213 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  31.3 
 
 
236 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 
245 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
236 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  34.18 
 
 
276 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  38 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  35.64 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  35.24 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  35.89 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.5 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  33.19 
 
 
235 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  34.58 
 
 
237 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.81 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.2 
 
 
238 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  29.18 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  31.44 
 
 
234 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.25 
 
 
389 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.05 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  26.72 
 
 
243 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  41.45 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  40.44 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  30.34 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  40.88 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  41.33 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
233 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  31.56 
 
 
237 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  32.76 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  30.62 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  40.99 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  39.33 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  30.34 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  34 
 
 
267 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  38.24 
 
 
228 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  36.22 
 
 
248 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  36.96 
 
 
254 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  34.5 
 
 
245 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  37.5 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  39.61 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  33.5 
 
 
245 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  32.73 
 
 
244 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  30.99 
 
 
238 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
238 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  37.65 
 
 
228 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
232 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
259 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  31 
 
 
265 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  32.37 
 
 
243 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  33.68 
 
 
249 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 
229 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  32.63 
 
 
269 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  36.56 
 
 
228 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  33.86 
 
 
237 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  35.14 
 
 
261 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>