44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1252 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  22.28 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  25.34 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  32.58 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  34.12 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  33.71 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  32.58 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.59 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  23.59 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  32.89 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  32.89 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  20.1 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  32.56 
 
 		 469 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.1 
 
 		 435 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  35.44 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  31.65 
 
 		 161 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  31.82 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  21.18 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.49 
 
 		 589 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 		 390 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.73 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  31.03 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.76 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  28.26 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  21.43 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  33.96 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  34.52 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  21.9 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  29.73 
 
 		 622 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  31.08 
 
 		 604 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3503  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  26.25 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.38 
 
 		 596 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 		 288 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.73 
 
 		 589 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.73 
 
 		 598 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.34 
 
 		 596 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  31.17 
 
 		 691 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.63 
 
 		 466 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.63 
 
 		 466 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  21.43 
 
 		 178 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>