More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1245 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 693 aa  1386    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.07 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  25.8 
 
 		 702 aa  130  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.06 
 
 		 702 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  27.16 
 
 		 864 aa  97.8  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  29.82 
 
 		 993 aa  95.5  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 993 aa  95.5  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  25.99 
 
 		 891 aa  92  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 993 aa  91.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 		 700 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  28.53 
 
 		 935 aa  86.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 994 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  25.81 
 
 		 1019 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.09 
 
 		 890 aa  80.9  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  28.9 
 
 		 858 aa  80.1  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.33 
 
 		 895 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  29.83 
 
 		 1007 aa  78.2  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 806 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  28.4 
 
 		 1265 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  26.32 
 
 		 891 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  26.15 
 
 		 802 aa  77.4  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.64 
 
 		 1031 aa  77.8  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.91 
 
 		 1232 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  28.41 
 
 		 1238 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  27.09 
 
 		 910 aa  76.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  23.48 
 
 		 1016 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25.28 
 
 		 924 aa  75.5  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.22 
 
 		 1019 aa  75.1  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  32.92 
 
 		 1234 aa  74.7  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25 
 
 		 902 aa  74.7  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  25.68 
 
 		 1003 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1042 aa  71.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  24.79 
 
 		 1099 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.41 
 
 		 851 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  29.01 
 
 		 1213 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  27.75 
 
 		 961 aa  70.1  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  25.61 
 
 		 1214 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  26.52 
 
 		 1008 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  30.13 
 
 		 1103 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 1022 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  31.01 
 
 		 1232 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  23.65 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  27.93 
 
 		 1227 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.75 
 
 		 1046 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.22 
 
 		 926 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  28.48 
 
 		 1048 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1047 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.35 
 
 		 859 aa  68.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  28.48 
 
 		 1048 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1048 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  25.41 
 
 		 1007 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  27.04 
 
 		 859 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  25.17 
 
 		 1021 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  25.48 
 
 		 1214 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  25.6 
 
 		 1182 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  28.12 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  24.68 
 
 		 1155 aa  66.6  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  27.04 
 
 		 859 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  28.12 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  28.12 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  28.12 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 		 1214 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  25.63 
 
 		 1211 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  24.79 
 
 		 1214 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  27.17 
 
 		 1229 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  27.85 
 
 		 1226 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  28.24 
 
 		 1227 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  27.17 
 
 		 1220 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  27.17 
 
 		 1229 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  28.66 
 
 		 1091 aa  65.1  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 1023 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  31.18 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  27.81 
 
 		 1023 aa  64.3  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  28.21 
 
 		 1137 aa  64.3  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  28.57 
 
 		 1083 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  28.57 
 
 		 1088 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.42 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  27.66 
 
 		 1247 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  26.32 
 
 		 857 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  21.95 
 
 		 804 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  29.1 
 
 		 888 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 		 1189 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.68 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  25.9 
 
 		 1214 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1196 aa  62  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.16 
 
 		 1057 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  30.99 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.5 
 
 		 1108 aa  62  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1196 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 		 1214 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.47 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  28.26 
 
 		 1164 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 		 1165 aa  61.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.19 
 
 		 1189 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 		 1177 aa  60.8  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>