More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1223 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.93 
 
 		 723 aa  705    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.12 
 
 		 781 aa  671    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.47 
 
 		 740 aa  692    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.72 
 
 		 735 aa  701    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.4 
 
 		 768 aa  754    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.06 
 
 		 769 aa  754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.8 
 
 		 759 aa  707    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.29 
 
 		 737 aa  670    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.88 
 
 		 753 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.32 
 
 		 738 aa  710    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.42 
 
 		 731 aa  711    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  100 
 
 		 721 aa  1464    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  46.81 
 
 		 754 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.19 
 
 		 781 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  47.43 
 
 		 713 aa  637    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.17 
 
 		 740 aa  696    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.56 
 
 		 731 aa  716    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.42 
 
 		 731 aa  709    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.7 
 
 		 738 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.38 
 
 		 784 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.02 
 
 		 737 aa  660    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.13 
 
 		 743 aa  687    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.35 
 
 		 742 aa  696    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.25 
 
 		 760 aa  672    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.57 
 
 		 709 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.98 
 
 		 701 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.75 
 
 		 739 aa  694    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.75 
 
 		 719 aa  690    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.34 
 
 		 721 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.88 
 
 		 756 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.03 
 
 		 727 aa  686    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.45 
 
 		 732 aa  763    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.59 
 
 		 718 aa  751    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.44 
 
 		 738 aa  665    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.42 
 
 		 731 aa  712    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.33 
 
 		 742 aa  687    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.84 
 
 		 736 aa  684    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.87 
 
 		 754 aa  632  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.68 
 
 		 806 aa  633  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.56 
 
 		 754 aa  634  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.35 
 
 		 754 aa  634  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  47.59 
 
 		 722 aa  633  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.69 
 
 		 852 aa  628  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.92 
 
 		 715 aa  630  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.22 
 
 		 808 aa  631  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.15 
 
 		 757 aa  627  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  43.48 
 
 		 775 aa  627  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.73 
 
 		 772 aa  625  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.23 
 
 		 804 aa  622  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.36 
 
 		 805 aa  622  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.82 
 
 		 704 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  43.46 
 
 		 764 aa  621  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.35 
 
 		 805 aa  620  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.83 
 
 		 736 aa  621  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  44.34 
 
 		 763 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.86 
 
 		 773 aa  618  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  45.79 
 
 		 732 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  46.51 
 
 		 718 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.96 
 
 		 754 aa  610  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.49 
 
 		 757 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.76 
 
 		 757 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.55 
 
 		 755 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.51 
 
 		 810 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  43.45 
 
 		 810 aa  594  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.83 
 
 		 800 aa  594  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.18 
 
 		 801 aa  591  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.23 
 
 		 763 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 826 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.52 
 
 		 730 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.5 
 
 		 801 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  42.44 
 
 		 804 aa  571  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  43.02 
 
 		 810 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  44.68 
 
 		 829 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  44.63 
 
 		 814 aa  558  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  43.22 
 
 		 806 aa  555  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  43.06 
 
 		 739 aa  542  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  41.58 
 
 		 703 aa  537  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  41.89 
 
 		 699 aa  535  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  42.98 
 
 		 746 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  39.35 
 
 		 776 aa  515  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  46.13 
 
 		 639 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  39.89 
 
 		 703 aa  500  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  40.76 
 
 		 930 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  45.37 
 
 		 788 aa  489  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  47.33 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  43.82 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  45.2 
 
 		 647 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  47.64 
 
 		 601 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  44.1 
 
 		 550 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  42.38 
 
 		 803 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  39.97 
 
 		 691 aa  441  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  41.67 
 
 		 567 aa  442  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  39.93 
 
 		 832 aa  425  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  40.07 
 
 		 729 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  36.59 
 
 		 756 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  36.85 
 
 		 607 aa  350  5e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 		 599 aa  341  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  31.33 
 
 		 750 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  35.58 
 
 		 749 aa  337  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  39.03 
 
 		 537 aa  335  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>