54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1129 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  939    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  83.74 
 
 
343 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  74.02 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  62.84 
 
 
318 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  56 
 
 
509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  64.23 
 
 
556 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  42.64 
 
 
257 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  57.85 
 
 
275 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  49.23 
 
 
287 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  56.12 
 
 
239 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  56.52 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  43.48 
 
 
623 aa  97.4  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1753  hypothetical protein  42.45 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  50.65 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  47.13 
 
 
152 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  41.41 
 
 
539 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  36.73 
 
 
1626 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  44.44 
 
 
97 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  42.47 
 
 
1544 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  38.89 
 
 
771 aa  64.7  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  32.85 
 
 
280 aa  65.1  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
336 aa  63.9  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  38.04 
 
 
631 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  41.1 
 
 
610 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  39.74 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  43.04 
 
 
97 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  38.36 
 
 
603 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
680 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  45.16 
 
 
608 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 
174 aa  53.5  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  38.32 
 
 
221 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  34.21 
 
 
179 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 
136 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 
109 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  34.78 
 
 
153 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  32.63 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  29.84 
 
 
114 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.28 
 
 
648 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  34.62 
 
 
117 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 
85 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  33.01 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
123 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  35.29 
 
 
112 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
193 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  32.47 
 
 
72 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
112 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  32.47 
 
 
110 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  29.76 
 
 
264 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00862  hypothetical protein  31.43 
 
 
337 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.329819  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 
123 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  34.67 
 
 
456 aa  43.9  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  30.56 
 
 
1145 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  37.14 
 
 
157 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>