143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1073 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
9585 aa  18880    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.81 
 
 
1462 aa  208  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.28 
 
 
1628 aa  166  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  31.41 
 
 
1879 aa  160  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  44.26 
 
 
1367 aa  146  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  30.86 
 
 
2039 aa  130  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  36.2 
 
 
771 aa  130  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  41.26 
 
 
1199 aa  129  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  29.87 
 
 
2067 aa  127  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.24 
 
 
2068 aa  122  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  32.22 
 
 
2047 aa  119  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.43 
 
 
2042 aa  115  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  31.13 
 
 
2069 aa  110  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  31.38 
 
 
2084 aa  109  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.89 
 
 
3544 aa  108  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  28.35 
 
 
2052 aa  108  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  30.51 
 
 
864 aa  105  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  33.57 
 
 
2011 aa  104  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.21 
 
 
782 aa  103  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  41.62 
 
 
3911 aa  99.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  28 
 
 
804 aa  100  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  28.41 
 
 
2056 aa  100  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  30.44 
 
 
2040 aa  99.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  33.22 
 
 
428 aa  98.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.6 
 
 
903 aa  95.9  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.4 
 
 
480 aa  95.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  28.53 
 
 
865 aa  92.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.73 
 
 
2476 aa  91.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  34.17 
 
 
725 aa  89.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.81 
 
 
2192 aa  89.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  31.18 
 
 
448 aa  90.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  25.93 
 
 
2043 aa  89.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.11 
 
 
3699 aa  89  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  29.54 
 
 
2027 aa  88.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  26.55 
 
 
1973 aa  88.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.03 
 
 
1355 aa  88.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  33.78 
 
 
1364 aa  86.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.72 
 
 
3699 aa  82.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  28.11 
 
 
2503 aa  81.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.88 
 
 
1042 aa  81.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  26.83 
 
 
2051 aa  79.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  34.74 
 
 
1994 aa  79.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27.68 
 
 
1067 aa  79.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  32.56 
 
 
744 aa  79  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  29.39 
 
 
801 aa  77.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  24.62 
 
 
741 aa  77.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.96 
 
 
2522 aa  76.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  31.61 
 
 
656 aa  74.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.23 
 
 
680 aa  74.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  30.5 
 
 
1221 aa  74.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  27.32 
 
 
1351 aa  73.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.09 
 
 
795 aa  73.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  47 
 
 
340 aa  72.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.34 
 
 
803 aa  71.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.11 
 
 
1550 aa  71.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 
1363 aa  71.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  32.08 
 
 
692 aa  71.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  31.35 
 
 
683 aa  69.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31.19 
 
 
918 aa  70.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.74 
 
 
1380 aa  68.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29 
 
 
3507 aa  68.6  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.51 
 
 
6885 aa  68.6  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 
822 aa  67.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.86 
 
 
1160 aa  66.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.19 
 
 
1735 aa  66.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  29.68 
 
 
1911 aa  65.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  45.54 
 
 
14944 aa  65.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  32.14 
 
 
1363 aa  65.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  37.5 
 
 
1017 aa  64.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  27.56 
 
 
2764 aa  63.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  41.51 
 
 
918 aa  63.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  27.04 
 
 
701 aa  62.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  26.38 
 
 
841 aa  62.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  27.33 
 
 
1052 aa  61.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  24.57 
 
 
388 aa  60.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  24.77 
 
 
779 aa  60.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  22.22 
 
 
410 aa  59.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  29.44 
 
 
445 aa  58.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  22.82 
 
 
3333 aa  58.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  22.71 
 
 
410 aa  57.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.9 
 
 
1066 aa  57.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  32.42 
 
 
409 aa  57.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.68 
 
 
2170 aa  57.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  36.27 
 
 
1242 aa  57.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  30 
 
 
613 aa  57.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  27.23 
 
 
995 aa  56.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  44.32 
 
 
1848 aa  57  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  36.07 
 
 
972 aa  56.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  29.47 
 
 
1050 aa  56.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0773  Fibronectin type III domain protein  27.23 
 
 
554 aa  56.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.310071  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
776 aa  54.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  54.7  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  28.31 
 
 
999 aa  54.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.36 
 
 
4433 aa  53.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  23.72 
 
 
454 aa  53.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  25.17 
 
 
836 aa  54.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  32.32 
 
 
973 aa  54.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3717  hypothetical protein  42.71 
 
 
321 aa  54.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.518311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  28.32 
 
 
670 aa  53.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.71 
 
 
2334 aa  53.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>