More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0994 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
281 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
296 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
295 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
288 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
287 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
288 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
314 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
350 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
291 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
291 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
291 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
350 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
340 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
295 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.68 
 
 
278 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
288 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
340 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
340 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
340 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
316 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
339 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
286 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.45 
 
 
341 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
287 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
287 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
273 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
293 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
276 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
322 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
340 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
299 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
333 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
315 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
340 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  27.37 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.9 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  26.35 
 
 
330 aa  96.3  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.31 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  23.79 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
329 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.82 
 
 
313 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
253 aa  94  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.09 
 
 
287 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.86 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.86 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
283 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.47 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  22.76 
 
 
289 aa  92.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 
308 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
279 aa  92  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.63 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.24 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  27.56 
 
 
252 aa  89  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
252 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 
308 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
286 aa  89  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  30.4 
 
 
571 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  26.02 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  24.35 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
312 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>