49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0918 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  51.85 
 
 
539 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  25.17 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  28.67 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  49.37 
 
 
358 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  46.75 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  46.84 
 
 
623 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  44.32 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  43.59 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  41.03 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  41.03 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  32.85 
 
 
454 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  34.91 
 
 
174 aa  59.3  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  36.71 
 
 
97 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  33.02 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  37.97 
 
 
97 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0345  hypothetical protein  30.91 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  28.05 
 
 
116 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.05 
 
 
114 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.51 
 
 
179 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  37.68 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  35.9 
 
 
124 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.62 
 
 
85 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  35.9 
 
 
110 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 
120 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 
192 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  35.56 
 
 
545 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  35.62 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
112 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  36.84 
 
 
771 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0343  hypothetical protein  28.69 
 
 
294 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  35.14 
 
 
173 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.53 
 
 
127 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  34.25 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
749 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.05 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 
117 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 
113 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  36.36 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.71 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0004  hypothetical protein  37.18 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 
109 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  27.85 
 
 
123 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  29.87 
 
 
112 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  32.67 
 
 
144 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 
112 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 
112 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0344  hypothetical protein  45.1 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>