More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0823 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  35.95 
 
 
244 aa  141  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  34.8 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.12 
 
 
239 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  35.38 
 
 
225 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  32.07 
 
 
243 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  34.15 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  37.74 
 
 
243 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 
243 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  29.95 
 
 
242 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  32.51 
 
 
249 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  30.95 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  36.23 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  31.78 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  30.26 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  31.55 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.22 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  35.43 
 
 
211 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  30.92 
 
 
242 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  32.37 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  29.47 
 
 
242 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  29.67 
 
 
241 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  29.09 
 
 
228 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  32.46 
 
 
186 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  28.99 
 
 
242 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  28.99 
 
 
242 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  28.99 
 
 
242 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  28.43 
 
 
238 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  28.99 
 
 
242 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  28.77 
 
 
213 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  28.51 
 
 
239 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  29.07 
 
 
238 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  30.29 
 
 
233 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  29.33 
 
 
266 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  32.09 
 
 
186 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  27.62 
 
 
244 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  31.07 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  26.96 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  32.39 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  28.76 
 
 
238 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.93 
 
 
646 aa  98.6  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  30.95 
 
 
248 aa  98.2  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  31.55 
 
 
190 aa  98.2  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  29.76 
 
 
474 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  28.64 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  27.7 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  25.97 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  25.23 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  26.79 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  28.11 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  26.92 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  26.57 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  27.84 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  29.27 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  26.92 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  26.92 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  24.89 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  26.92 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  26.92 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  26.92 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  26.92 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  26.83 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  26.41 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  26.83 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  26.92 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  32.58 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  29.13 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  26.39 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  30.06 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  26.34 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  28.64 
 
 
226 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  28.3 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  24.89 
 
 
234 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  28.24 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  26.34 
 
 
228 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  26.34 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  29.55 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  26.54 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  29.72 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  26.94 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  30 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  26.94 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  26.73 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  28.88 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  27.27 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  26.39 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1996  dithiobiotin synthetase  24.68 
 
 
225 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  26.55 
 
 
202 aa  92  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  25.13 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  28.14 
 
 
221 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  29.61 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  27.91 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  26.82 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  27.23 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  30.29 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  25 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>