More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0778 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  36.64 
 
 		 186 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 185 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 186 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  34.35 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 189 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  34.44 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.61 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  33.11 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  31.53 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  30.89 
 
 		 313 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.11 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.93 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.09 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  32.5 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.48 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.2 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  26.45 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 		 283 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  30.47 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.83 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  35.66 
 
 		 214 aa  70.1  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.37 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  32.48 
 
 		 614 aa  69.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  30.17 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  33.04 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.64 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  29.31 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  29.37 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  32.5 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  29.84 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.04 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.11 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.57 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  29.57 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  37.23 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  27.5 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  30.47 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  28.44 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.63 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.21 
 
 		 586 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3498  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156756  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  26.61 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  26.23 
 
 		 605 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.67 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  27.27 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  26.61 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.2 
 
 		 688 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.33 
 
 		 605 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  24.14 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  30.83 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>