More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0657 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  913    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  39.03 
 
 
429 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  38.99 
 
 
423 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  38.48 
 
 
429 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  37.1 
 
 
427 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  36.49 
 
 
425 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  39.68 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  38.02 
 
 
433 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  36.49 
 
 
432 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  35.2 
 
 
430 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  36.92 
 
 
425 aa  296  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  36.72 
 
 
430 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  36.93 
 
 
437 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  35.29 
 
 
425 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  37.9 
 
 
438 aa  293  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  36.16 
 
 
437 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  37.35 
 
 
428 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  35.76 
 
 
412 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  36.04 
 
 
432 aa  286  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  35.62 
 
 
434 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  37.06 
 
 
415 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  36.6 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  35.06 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  36.13 
 
 
415 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  36.05 
 
 
383 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  35.99 
 
 
398 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 
423 aa  279  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 
385 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  34.82 
 
 
437 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  34.79 
 
 
395 aa  275  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  34.25 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  34.69 
 
 
437 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  34.02 
 
 
426 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  34.95 
 
 
723 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  35.24 
 
 
437 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  34.24 
 
 
447 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  33.41 
 
 
427 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  33.63 
 
 
442 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  34.5 
 
 
386 aa  266  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  32.81 
 
 
408 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  31.43 
 
 
433 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 
434 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  34.25 
 
 
444 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  35.63 
 
 
442 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  33.05 
 
 
470 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 
434 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  32.4 
 
 
419 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.03 
 
 
468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  35.24 
 
 
388 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  32.48 
 
 
417 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  35.28 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  33.11 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  32.21 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  33.26 
 
 
415 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  31.25 
 
 
418 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
416 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
433 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  31.87 
 
 
459 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.8 
 
 
444 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  32.33 
 
 
417 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  32.12 
 
 
433 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  33.1 
 
 
386 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  33.56 
 
 
404 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  32.96 
 
 
426 aa  247  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  34.61 
 
 
448 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  31.67 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  35.19 
 
 
455 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  31.34 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  32.26 
 
 
418 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  32.96 
 
 
451 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  33.33 
 
 
411 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  32.18 
 
 
418 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  35.76 
 
 
417 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  32.03 
 
 
393 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  32.88 
 
 
411 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  32.25 
 
 
446 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  33.18 
 
 
414 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  30.13 
 
 
419 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 
420 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  31.26 
 
 
420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  32.89 
 
 
412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  32.96 
 
 
451 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  32.43 
 
 
407 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.18 
 
 
433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  33.26 
 
 
446 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  32.51 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  32.83 
 
 
418 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  31.91 
 
 
408 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  31.91 
 
 
408 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  31.97 
 
 
408 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  31.67 
 
 
487 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.17 
 
 
439 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  30.21 
 
 
383 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  33.1 
 
 
424 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  32.71 
 
 
412 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.11 
 
 
506 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  29.89 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  29.89 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>