More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0500 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
408 aa  833    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  40.72 
 
 
419 aa  322  7e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  42.78 
 
 
388 aa  310  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  39.05 
 
 
408 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  39.52 
 
 
414 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 
405 aa  300  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  40 
 
 
414 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  38.85 
 
 
414 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
412 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
404 aa  295  7e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  40.74 
 
 
408 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 
404 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  37.78 
 
 
407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  40.59 
 
 
412 aa  289  6e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  39.31 
 
 
413 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  36.87 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.12 
 
 
404 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 
409 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  38.21 
 
 
413 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  39.8 
 
 
415 aa  273  6e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  35.7 
 
 
409 aa  265  8e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
408 aa  256  6e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  38.56 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  37.28 
 
 
407 aa  249  7e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
408 aa  246  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
402 aa  230  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  36.12 
 
 
407 aa  229  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  37.97 
 
 
394 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  35.82 
 
 
394 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  36.48 
 
 
407 aa  222  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  35.48 
 
 
393 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  36.72 
 
 
389 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  36.07 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  36.97 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  35.45 
 
 
396 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  34.91 
 
 
396 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  35.25 
 
 
392 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  36.19 
 
 
400 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  35.25 
 
 
396 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  37.01 
 
 
396 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  34.9 
 
 
395 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  35.64 
 
 
395 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
392 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  34.62 
 
 
402 aa  205  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
395 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.01 
 
 
646 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  33 
 
 
393 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  34.58 
 
 
389 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
395 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
388 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  35.4 
 
 
397 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 
399 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  34.47 
 
 
396 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  35.98 
 
 
398 aa  202  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  33.91 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  33.99 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  36.36 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  33.01 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  34.42 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  34 
 
 
397 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  34.47 
 
 
397 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  34.83 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  32.68 
 
 
399 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  33.75 
 
 
397 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  33.81 
 
 
395 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  35.85 
 
 
404 aa  199  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  35.66 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  34.57 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  32.52 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  33.75 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  32.77 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.63 
 
 
650 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  35.06 
 
 
397 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  32.69 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  34.81 
 
 
397 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3269  Phosphoglycerate kinase  33.42 
 
 
397 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.891729  decreased coverage  0.00998041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
393 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  34.74 
 
 
394 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
396 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
396 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  32.84 
 
 
396 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  34.81 
 
 
398 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
397 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  31.59 
 
 
394 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  33.92 
 
 
399 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  34.55 
 
 
403 aa  192  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  32.75 
 
 
394 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
407 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  34.3 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  30.81 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  31.25 
 
 
394 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  33.92 
 
 
398 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
394 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  31.37 
 
 
400 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  34.89 
 
 
398 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  33.42 
 
 
395 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  32.1 
 
 
395 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>