More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0446 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 441 aa  844    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  33 
 
 		 585 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 585 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 586 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.58 
 
 		 587 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  34.33 
 
 		 585 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  34.33 
 
 		 585 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 		 587 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 585 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.83 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 586 aa  202  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  33.17 
 
 		 741 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 745 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  33.76 
 
 		 741 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 		 757 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 710 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 747 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 674 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 		 782 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 773 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 775 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 664 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 671 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 666 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.74 
 
 		 663 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 636 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 741 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 567 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.48 
 
 		 670 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.67 
 
 		 671 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.67 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 654 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 673 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  29.23 
 
 		 582 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 762 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 567 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 771 aa  140  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.24 
 
 		 567 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 693 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 		 688 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 584 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.78 
 
 		 648 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 658 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  27.23 
 
 		 649 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 674 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.8 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 665 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 668 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 656 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 595 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 585 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 586 aa  133  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.85 
 
 		 648 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.28 
 
 		 682 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 659 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  25.19 
 
 		 649 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 652 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  27.95 
 
 		 648 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  28.15 
 
 		 666 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 606 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 777 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  25.67 
 
 		 650 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 668 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  28.4 
 
 		 555 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 667 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 		 764 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.71 
 
 		 697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  29.33 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.32 
 
 		 648 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.32 
 
 		 648 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 		 667 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.32 
 
 		 648 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 672 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  29.05 
 
 		 657 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 678 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1278  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 575 aa  126  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 		 584 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.25 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.25 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  25.44 
 
 		 648 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.3 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 606 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 659 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  29 
 
 		 541 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 684 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 668 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 668 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 668 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 653 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>