More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0248 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 305 aa  634    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  43.56 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  41.58 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  40.92 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  40.92 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  40.92 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  42.67 
 
 		 319 aa  244  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 311 aa  244  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  40.59 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  43.89 
 
 		 303 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  42.38 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  40.45 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.32 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  41.42 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  40.92 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  38.03 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 317 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  38.96 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  40.73 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  40.73 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  40.47 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  38.36 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.47 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.3 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  36.6 
 
 		 322 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  37.38 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  39.4 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  39.48 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  38.36 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  37.05 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  39.74 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>