43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0232 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  39.84 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  38.58 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  35.51 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  31.39 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  34.27 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  32 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  28.99 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  32.06 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  26.4 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  30.43 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  26.81 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  30.47 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  30.94 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  30.66 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  26.72 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  28.47 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  24.29 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  24.39 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  26.12 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  29.37 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  26.71 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  23.57 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  25.36 
 
 
141 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  25.4 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  26.56 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  27.07 
 
 
143 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  23.02 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  24 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  21.9 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  22.7 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  26.62 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  23.88 
 
 
135 aa  43.9  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 
542 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  23.49 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  24.04 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  24.03 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>