31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0220 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 		 55 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  54 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.135184 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  52 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  56.86 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  52.83 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  46.15 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  53.85 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  53.85 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  51.92 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  51.92 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  51.02 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  50 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.973212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  51.92 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  54.9 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00700  PRCDNA38, putative  50 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  47.06 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  45.1 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  49.02 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  53.06 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  47.06 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  47.06 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  45.1 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  46.3 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  46 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  47.17 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  50.98 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  45.1 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  49.02 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  47.27 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  42.31 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  41.18 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.762385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>