87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0185 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  62.11 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  57.45 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  56.52 
 
 
454 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  52.78 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  46.07 
 
 
623 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  43.16 
 
 
287 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  43.3 
 
 
152 aa  93.6  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  42.16 
 
 
539 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  42.11 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  34.35 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  34.82 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  41.03 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  39.47 
 
 
179 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
97 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  41.3 
 
 
153 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  31.2 
 
 
174 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  35.23 
 
 
192 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  34.38 
 
 
112 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
167 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
114 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  38.75 
 
 
113 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  36.25 
 
 
136 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  40 
 
 
110 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  28.84 
 
 
486 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 
112 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  57  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  34.04 
 
 
771 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 
97 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 
113 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  33.75 
 
 
114 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  37.66 
 
 
72 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  40.91 
 
 
112 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 
113 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.91 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  36.36 
 
 
456 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  38.03 
 
 
372 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  35 
 
 
110 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  32.5 
 
 
114 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  35.44 
 
 
123 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 
85 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 
120 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
117 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1935  hypothetical protein  35.85 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.187916  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  34.72 
 
 
123 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.76 
 
 
9585 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32 
 
 
104 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  34.67 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  25 
 
 
451 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.91 
 
 
749 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 
116 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  32.35 
 
 
119 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  37.31 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  36.99 
 
 
157 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 
119 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  28.4 
 
 
466 aa  45.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  32.47 
 
 
124 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  32 
 
 
104 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  29.79 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  36.84 
 
 
107 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  31.87 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  41.56 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  36.67 
 
 
130 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  33.98 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  23.84 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  36.14 
 
 
127 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3554  multicopper oxidase type 2  29.17 
 
 
407 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  24.09 
 
 
521 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  32.65 
 
 
140 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  27.43 
 
 
224 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  33.73 
 
 
112 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  30.51 
 
 
534 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  24.53 
 
 
246 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 
105 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  32.5 
 
 
149 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  30.3 
 
 
154 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  28.42 
 
 
545 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
144 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  33.7 
 
 
158 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3146  rusticyanin  29.75 
 
 
187 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000525489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  32.47 
 
 
119 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2743  rusticyanin  29.75 
 
 
187 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000172959  hitchhiker  0.0000000144714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
159 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  33.33 
 
 
192 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  62.5 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>