More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0172 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  43.88 
 
 
113 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  44.09 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  45.05 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  45.45 
 
 
164 aa  98.2  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  43.48 
 
 
118 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  42.39 
 
 
112 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  41.94 
 
 
111 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  40.86 
 
 
111 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  39.58 
 
 
120 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  45.83 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  41.67 
 
 
113 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  42.39 
 
 
124 aa  92  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  42.05 
 
 
154 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  40.43 
 
 
105 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  44.94 
 
 
128 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  44.09 
 
 
108 aa  90.1  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  46.24 
 
 
108 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  45.16 
 
 
99 aa  90.1  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  39.6 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.17 
 
 
100 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  89  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  42.7 
 
 
124 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  45.35 
 
 
106 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  89  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  42.55 
 
 
183 aa  89  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  40.78 
 
 
106 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 
99 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.95 
 
 
108 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
99 aa  88.6  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  42.7 
 
 
133 aa  88.2  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  39.58 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  43.33 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  42.11 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  40.86 
 
 
156 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  43.01 
 
 
107 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  42.7 
 
 
122 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  40.66 
 
 
120 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.17 
 
 
100 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  43.96 
 
 
131 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  35.42 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  39.58 
 
 
120 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  40.66 
 
 
123 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  85.5  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  43.16 
 
 
182 aa  85.5  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  40.66 
 
 
112 aa  85.1  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  41.57 
 
 
110 aa  85.1  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 
104 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42 
 
 
105 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  41.57 
 
 
123 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  40.59 
 
 
105 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  40.62 
 
 
121 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  39.78 
 
 
99 aa  84  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  41.57 
 
 
122 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  43.82 
 
 
126 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  40.66 
 
 
130 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  36.63 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 
107 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  40.54 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  42.05 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  42.05 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  40.59 
 
 
105 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  39.56 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  37.89 
 
 
142 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.58 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  39.56 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  38.3 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  39.56 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40.91 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  38.78 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  38.54 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  39.58 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  35.42 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  39.56 
 
 
110 aa  82  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  41.57 
 
 
126 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  38.54 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  39 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  38.38 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  38.38 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  39.39 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  36.36 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  36 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  43.53 
 
 
102 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  40.91 
 
 
126 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  40.86 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>