More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0140 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0140  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 
352 aa  717    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000672144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0987  hypothetical protein  53.05 
 
 
344 aa  365  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.861522  normal  0.983085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  33.13 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  33.03 
 
 
351 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  31.21 
 
 
341 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  31.91 
 
 
338 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30.93 
 
 
352 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.92 
 
 
333 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13506  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  32.53 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.14 
 
 
341 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.82 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  31.82 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.36 
 
 
350 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.63 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.47 
 
 
343 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.45 
 
 
353 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.45 
 
 
353 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.45 
 
 
353 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.82 
 
 
345 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.88 
 
 
350 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.54 
 
 
342 aa  176  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.94 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.4 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.85 
 
 
363 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.15 
 
 
352 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.61 
 
 
339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.61 
 
 
337 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.14 
 
 
340 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29 
 
 
337 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  29.85 
 
 
358 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.22 
 
 
338 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.08 
 
 
342 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.96 
 
 
346 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30 
 
 
355 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27 
 
 
347 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.59 
 
 
338 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.06 
 
 
346 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.78 
 
 
347 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.44 
 
 
336 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.78 
 
 
347 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.78 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.24 
 
 
349 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4142  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.79 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345683  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.35 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1390  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.66 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.91 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0938  pyruvate carboxyltransferase  29.48 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  26.95 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.04 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.61 
 
 
337 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.64 
 
 
349 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.43 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.63 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.61 
 
 
337 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  29.61 
 
 
337 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  27.3 
 
 
377 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.31 
 
 
337 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.54 
 
 
348 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.49 
 
 
347 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.84 
 
 
339 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2266  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.61 
 
 
349 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.83 
 
 
339 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.76 
 
 
348 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.76 
 
 
348 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.49 
 
 
358 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.83 
 
 
345 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.83 
 
 
340 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  29.31 
 
 
337 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.31 
 
 
337 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.31 
 
 
337 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3340  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.64 
 
 
345 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.31 
 
 
337 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
339 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.46 
 
 
345 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.52 
 
 
338 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3808  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.89 
 
 
354 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1356  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
341 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315609  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3782  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
343 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132255  hitchhiker  0.000807704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.06 
 
 
352 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.83 
 
 
349 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.99 
 
 
342 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.83 
 
 
349 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.08 
 
 
350 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  29.24 
 
 
349 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.44 
 
 
342 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.27 
 
 
343 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1457  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.17 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322721  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.51 
 
 
355 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.79 
 
 
348 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4833  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.92 
 
 
354 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845453  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.7 
 
 
343 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.66 
 
 
349 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4923  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.48 
 
 
341 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854205  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3510  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.31 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.14 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2781  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.14 
 
 
344 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.018657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  29.11 
 
 
348 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.45 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.62 
 
 
352 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>