32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0093 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  703  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  30.42 
 
 
354 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  30.42 
 
 
350 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  30.34 
 
 
356 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  30.25 
 
 
358 aa  129  7e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  29.02 
 
 
353 aa  120  4e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  30.92 
 
 
338 aa  120  4e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  26.5 
 
 
350 aa  112  1e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  31.51 
 
 
337 aa  110  4e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  31.23 
 
 
337 aa  110  4e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  28.86 
 
 
337 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  27.36 
 
 
330 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  28.38 
 
 
329 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  29.39 
 
 
337 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  27.21 
 
 
333 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  25.23 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  28.35 
 
 
860 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  26.15 
 
 
340 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  26.18 
 
 
377 aa  73.2  7e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  25.07 
 
 
353 aa  72  1e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  23.94 
 
 
341 aa  68.2  2e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  26.74 
 
 
349 aa  67.8  3e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  27.08 
 
 
349 aa  67.8  3e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  20.31 
 
 
342 aa  62.4  1e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  25.25 
 
 
347 aa  60.5  5e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  24.92 
 
 
363 aa  58.2  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  2.18534e-05  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  19.38 
 
 
355 aa  57.4  4e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  25.68 
 
 
344 aa  51.2  2e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  22.37 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  26.01 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  1.53043e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  26.62 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>