More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0088 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
913 aa  1867  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.81 
 
 
932 aa  563  1e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  34.96 
 
 
955 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  34.25 
 
 
939 aa  551  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  34.18 
 
 
943 aa  538  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.19 
 
 
944 aa  532  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.92 
 
 
972 aa  527  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  34 
 
 
946 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  34.06 
 
 
954 aa  525  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
926 aa  504  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  32.93 
 
 
903 aa  502  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.55 
 
 
897 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  33.95 
 
 
898 aa  499  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.73 
 
 
909 aa  494  1e-138  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
916 aa  490  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
903 aa  486  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.23 
 
 
927 aa  483  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  2.20197e-08 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 
916 aa  464  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
970 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 
928 aa  462  1e-128  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.53 
 
 
928 aa  457  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  3.00252e-12 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
937 aa  459  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.37 
 
 
946 aa  457  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.27 
 
 
890 aa  454  1e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.12 
 
 
915 aa  454  1e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.62 
 
 
912 aa  448  1e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
905 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.11 
 
 
913 aa  426  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.97 
 
 
1688 aa  334  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  28.67 
 
 
1480 aa  298  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.04 
 
 
888 aa  297  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.86 
 
 
875 aa  290  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.35 
 
 
873 aa  288  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  27.53 
 
 
914 aa  287  6e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  27.76 
 
 
1544 aa  287  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.82 
 
 
874 aa  284  5e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.7 
 
 
874 aa  284  5e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.2 
 
 
874 aa  283  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.7 
 
 
931 aa  283  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.95 
 
 
933 aa  281  4e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  27.97 
 
 
870 aa  278  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
1534 aa  279  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.29 
 
 
872 aa  278  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.95 
 
 
922 aa  276  9e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28 
 
 
872 aa  275  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.11 
 
 
1516 aa  275  4e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  26.8 
 
 
915 aa  274  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.53 
 
 
1388 aa  272  3e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  29.72 
 
 
1431 aa  270  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  27.5 
 
 
1584 aa  268  3e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.55 
 
 
1523 aa  267  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
1523 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  27.41 
 
 
1523 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 
1475 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
1517 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  26.88 
 
 
1567 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  26.55 
 
 
1535 aa  257  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.34 
 
 
1514 aa  257  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  29.31 
 
 
1534 aa  257  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  26.97 
 
 
1495 aa  257  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.47 
 
 
900 aa  257  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.03 
 
 
1518 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.19 
 
 
1435 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  31.53 
 
 
1419 aa  254  4e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.23 
 
 
1508 aa  254  5e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.72 
 
 
1505 aa  254  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.35 
 
 
1429 aa  253  8e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.39 
 
 
1539 aa  253  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  26.88 
 
 
1493 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  26.56 
 
 
941 aa  253  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.38 
 
 
1412 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 
1613 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  30.63 
 
 
710 aa  252  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.54 
 
 
1480 aa  251  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  30.02 
 
 
1515 aa  251  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.33 
 
 
1426 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
1497 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.23 
 
 
1620 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  25.91 
 
 
1379 aa  248  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.01 
 
 
1451 aa  248  5e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  28.09 
 
 
1434 aa  247  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.11 
 
 
1561 aa  247  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  30.49 
 
 
1573 aa  247  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  26.19 
 
 
1536 aa  246  1e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  26.97 
 
 
1504 aa  246  2e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.52 
 
 
1510 aa  246  2e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  25.95 
 
 
1536 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.76 
 
 
807 aa  245  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.85 
 
 
1476 aa  244  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  27.04 
 
 
1531 aa  244  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.69 
 
 
1381 aa  243  8e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  25.32 
 
 
1572 aa  243  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  25.83 
 
 
1536 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  25.56 
 
 
1523 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.17 
 
 
1538 aa  242  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  31.02 
 
 
1448 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.28 
 
 
1538 aa  241  3e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  30.14 
 
 
1448 aa  242  3e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  25.44 
 
 
1601 aa  240  7e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  25.96 
 
 
1538 aa  240  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>