278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0069 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0069  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
320 aa  650  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  41.49 
 
 
927 aa  69.3  9e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 
409 aa  67.8  2e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
409 aa  65.1  2e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.79 
 
 
267 aa  61.2  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 
409 aa  61.6  2e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
833 aa  60.8  3e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
1022 aa  60.5  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15331  hypothetical protein  33.59 
 
 
557 aa  59.7  7e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.19 
 
 
810 aa  59.3  8e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
368 aa  59.3  9e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  35.63 
 
 
682 aa  58.5  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
534 aa  58.2  2e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  6.93072e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
988 aa  57.4  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
3145 aa  57.4  3e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
3035 aa  57.4  3e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
878 aa  57  4e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
565 aa  56.6  6e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.62 
 
 
632 aa  56.6  6e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  38.46 
 
 
681 aa  56.2  7e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  35.71 
 
 
832 aa  55.8  9e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.86 
 
 
875 aa  55.5  1e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.07 
 
 
573 aa  55.5  1e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33.75 
 
 
266 aa  55.1  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.86 
 
 
263 aa  55.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
3172 aa  54.7  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
3301 aa  55.1  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  35.9 
 
 
706 aa  55.1  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.33 
 
 
539 aa  54.7  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
263 aa  53.5  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 
199 aa  53.1  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 
338 aa  53.5  5e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
1827 aa  53.1  6e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.97 
 
 
820 aa  53.1  6e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 
222 aa  53.1  6e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 
689 aa  53.1  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.67 
 
 
462 aa  53.1  6e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 
293 aa  52.8  7e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
279 aa  53.1  7e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
289 aa  53.1  7e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
329 aa  52.8  8e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.82 
 
 
334 aa  52.8  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.36 
 
 
668 aa  52.4  9e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.79067e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.18 
 
 
1694 aa  52.8  9e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 
2240 aa  52.4  9e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
270 aa  52  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
209 aa  52.4  1e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
687 aa  52.4  1e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.97 
 
 
887 aa  52.4  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.58 
 
 
707 aa  52  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
270 aa  52  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.56 
 
 
582 aa  52  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
404 aa  51.6  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
602 aa  51.6  2e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
448 aa  51.2  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
1252 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
1252 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
486 aa  51.2  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
638 aa  51.6  2e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  32.69 
 
 
676 aa  51.2  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 
784 aa  51.2  3e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
1421 aa  50.8  3e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
1737 aa  50.8  3e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
1276 aa  50.8  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
750 aa  50.4  3e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
425 aa  50.4  3e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.37 
 
 
706 aa  50.8  3e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  23.64 
 
 
322 aa  50.8  3e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
268 aa  50.4  4e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  1.08911e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
649 aa  50.4  4e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
732 aa  50.4  4e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
361 aa  50.4  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31061e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
405 aa  50.4  4e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
547 aa  50.1  5e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.38 
 
 
233 aa  50.1  5e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
562 aa  50.1  5e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 
237 aa  50.1  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
265 aa  50.1  5e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
1979 aa  50.1  5e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
217 aa  49.7  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
568 aa  49.7  6e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.62187e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
399 aa  50.1  6e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
3560 aa  50.1  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 
289 aa  49.7  7e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
792 aa  49.7  7e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
718 aa  49.7  7e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  24.41 
 
 
1101 aa  49.7  7e-05  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.19 
 
 
397 aa  49.3  8e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.47 
 
 
750 aa  49.3  8e-05  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.75 
 
 
725 aa  49.3  8e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.26 
 
 
730 aa  49.3  9e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 
363 aa  49.3  9e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
890 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.04 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.26196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>