76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0067 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0067  hypothetical protein  100 
 
 
953 aa  1927  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0902  hypothetical protein  26.03 
 
 
892 aa  105  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1115  hypothetical protein  24.8 
 
 
930 aa  104  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2279  protein of unknown function UPF0182  25.42 
 
 
896 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.42741e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3693  hypothetical protein  22.58 
 
 
996 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2333  hypothetical protein  25.36 
 
 
894 aa  99  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.280552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1797  hypothetical protein  22.68 
 
 
932 aa  97.8  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2146  protein of unknown function UPF0182  22.19 
 
 
912 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3567  hypothetical protein  25.26 
 
 
900 aa  97.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00412787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0814  protein of unknown function UPF0182  25.36 
 
 
891 aa  96.3  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.297672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1951  hypothetical protein  22.64 
 
 
988 aa  96.3  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1139  hypothetical protein  23.35 
 
 
909 aa  95.5  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.827602  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1303  hypothetical protein  24.16 
 
 
899 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939701  normal  0.0211961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2689  hypothetical protein  24.9 
 
 
890 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.958793  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14611  hypothetical protein  22.32 
 
 
950 aa  92.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4385  hypothetical protein  22.85 
 
 
919 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.182735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1161  hypothetical protein  22.78 
 
 
914 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.100714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2777  protein of unknown function UPF0182  21.98 
 
 
960 aa  87.8  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.740282  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4195  hypothetical protein  22.28 
 
 
1004 aa  87  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4155  hypothetical protein  22.28 
 
 
1004 aa  87  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10710  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  23.41 
 
 
917 aa  86.7  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3465  protein of unknown function UPF0182  22.3 
 
 
896 aa  86.3  3e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07660  hypothetical protein  24.85 
 
 
988 aa  84  1e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.580652  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0938  hypothetical protein  24.05 
 
 
1019 aa  81.3  8e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391922  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5177  hypothetical protein  21.41 
 
 
1009 aa  75.9  4e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7927  protein of unknown function UPF0182  22.54 
 
 
962 aa  73.9  1e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0725  protein of unknown function UPF0182  22.92 
 
 
1018 aa  74.3  1e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1783  hypothetical protein  20.96 
 
 
955 aa  74.3  1e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.890136  normal  0.25047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2471  protein of unknown function UPF0182  23.14 
 
 
985 aa  73.9  1e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.677e-10 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2722  hypothetical protein  22.02 
 
 
991 aa  73.6  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177747  hitchhiker  0.000114433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0945  hypothetical protein  24.03 
 
 
1035 aa  73.2  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203937  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2461  protein of unknown function UPF0182  26.74 
 
 
1000 aa  72.8  3e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.947136  hitchhiker  8.99121e-06 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2952  hypothetical protein  23.71 
 
 
972 aa  72.4  3e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0447926  normal  0.518899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1700  protein of unknown function UPF0182  21.87 
 
 
893 aa  72.8  3e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14990  hypothetical protein  24.05 
 
 
1047 aa  72.4  4e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.589114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10064  transmembrane protein  23.61 
 
 
672 aa  71.2  8e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.849211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3729  hypothetical protein  24.37 
 
 
994 aa  70.9  1e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1323  hypothetical protein  21.78 
 
 
914 aa  70.1  2e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.707425  normal  0.117445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3037  protein of unknown function UPF0182  24.28 
 
 
985 aa  69.7  2e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27470  hypothetical protein  22.5 
 
 
1012 aa  70.1  2e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0961  hypothetical protein  24.1 
 
 
872 aa  68.9  4e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0949388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0011  hypothetical protein  20.37 
 
 
918 aa  68.6  6e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0693  protein of unknown function UPF0182  21.93 
 
 
909 aa  68.2  7e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3730  protein of unknown function UPF0182  23.33 
 
 
968 aa  67.8  9e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3487  protein of unknown function UPF0182  23.84 
 
 
994 aa  67.4  1e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0011  hypothetical protein  20.4 
 
 
918 aa  67  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0908  protein of unknown function UPF0182  24.15 
 
 
945 aa  65.9  3e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.747504  hitchhiker  0.000109139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2885  protein of unknown function UPF0182  23.09 
 
 
980 aa  66.2  3e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3781  hypothetical protein  20.8 
 
 
1018 aa  65.9  4e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568022  normal  0.0630741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19540  hypothetical protein  23.31 
 
 
1029 aa  65.5  4e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139911  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1151  hypothetical protein  23.28 
 
 
932 aa  65.1  6e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0967  protein of unknown function UPF0182  23.77 
 
 
959 aa  64.7  8e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000819285  normal  0.392007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8343  hypothetical protein  24.94 
 
 
983 aa  63.9  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.715387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2749  hypothetical protein  22.32 
 
 
1006 aa  63.5  2e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19060  hypothetical protein  24.89 
 
 
1045 aa  63.2  3e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.569882  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4110  hypothetical protein  23.06 
 
 
993 aa  62.8  3e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3795  protein of unknown function UPF0182  25.81 
 
 
1007 aa  61.6  6e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214749  normal  0.0401617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0698  protein of unknown function UPF0182  23.72 
 
 
945 aa  61.6  7e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00837363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4222  protein of unknown function UPF0182  23.01 
 
 
985 aa  61.6  7e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1871  protein of unknown function UPF0182  23.37 
 
 
949 aa  60.8  1e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0780  Na+-driven multidrug efflux pump  23.94 
 
 
1079 aa  59.7  2e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1599  protein of unknown function UPF0182  27 
 
 
982 aa  58.2  7e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217724  normal  0.364231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1814  hypothetical protein  22.57 
 
 
1002 aa  57.4  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693843  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1193  protein of unknown function UPF0182  20.83 
 
 
1019 aa  56.6  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111199  normal  0.0369409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4377  hypothetical protein  26.17 
 
 
992 aa  56.2  3e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13213  hypothetical protein  22.45 
 
 
992 aa  55.8  4e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1469  hypothetical protein  21.99 
 
 
1001 aa  54.7  9e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1415  hypothetical protein  21.99 
 
 
1003 aa  54.3  9e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1433  hypothetical protein  21.99 
 
 
1003 aa  54.3  9e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207138  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0793  protein of unknown function UPF0182  25.44 
 
 
1007 aa  53.9  1e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4654  hypothetical protein  24.56 
 
 
1004 aa  52.8  3e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344019  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1530  hypothetical protein  25.8 
 
 
1004 aa  52.4  4e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2137  hypothetical protein  22.52 
 
 
874 aa  51.6  7e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0489156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0941  hypothetical protein  22.3 
 
 
1001 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0541  hypothetical protein  22.19 
 
 
1018 aa  50.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0653  hypothetical protein  24.36 
 
 
1016 aa  44.7  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.523938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>