28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0066 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  100 
 
 
373 aa  768  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  31.32 
 
 
389 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  28.16 
 
 
374 aa  142  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  28.06 
 
 
390 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  26.65 
 
 
387 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  26.71 
 
 
395 aa  135  1e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  27.17 
 
 
312 aa  128  1e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  29.08 
 
 
312 aa  128  2e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  27.08 
 
 
312 aa  126  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  26.01 
 
 
378 aa  122  1e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  26.3 
 
 
348 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  27.79 
 
 
312 aa  120  4e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  25.91 
 
 
414 aa  120  5e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  24.41 
 
 
388 aa  117  2e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  26.79 
 
 
404 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  24.77 
 
 
380 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  25.54 
 
 
386 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  29.5 
 
 
330 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  27.57 
 
 
320 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  23.17 
 
 
391 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  24.94 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  22.99 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  22.93 
 
 
391 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  21.77 
 
 
355 aa  63.5  5e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  21.9 
 
 
357 aa  62.8  1e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  22.86 
 
 
357 aa  62.4  1e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  20.87 
 
 
363 aa  53.5  6e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  20.13 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>