23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0065 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  100 
 
 
341 aa  704  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  31.5 
 
 
413 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  30.9 
 
 
346 aa  148  2e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  29.14 
 
 
338 aa  146  4e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  29.82 
 
 
349 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  29.46 
 
 
364 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  29.19 
 
 
334 aa  142  1e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  30.46 
 
 
356 aa  139  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  28.03 
 
 
349 aa  131  2e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  27.7 
 
 
354 aa  126  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  24.93 
 
 
349 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  29.67 
 
 
330 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  27.95 
 
 
362 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  26.3 
 
 
361 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  27.17 
 
 
362 aa  112  1e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  26.74 
 
 
360 aa  111  2e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  21.97 
 
 
384 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  29.21 
 
 
427 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  27.92 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  28.64 
 
 
364 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  26.18 
 
 
307 aa  67  4e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  23.35 
 
 
389 aa  60.5  4e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  26.6 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>