171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0064 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 
279 aa  573  1e-162  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  49.29 
 
 
281 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  47.46 
 
 
291 aa  283  2e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  47 
 
 
286 aa  278  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  47.67 
 
 
282 aa  277  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  46.24 
 
 
286 aa  249  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  43.28 
 
 
278 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  39.42 
 
 
282 aa  228  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  39.07 
 
 
289 aa  218  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  40.6 
 
 
286 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  41.84 
 
 
281 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  39.78 
 
 
293 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  39.57 
 
 
276 aa  213  2e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  38.83 
 
 
293 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  42.08 
 
 
281 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  38.77 
 
 
292 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  42.42 
 
 
286 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  42.08 
 
 
281 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  39.77 
 
 
283 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  39.43 
 
 
282 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  40 
 
 
283 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  40.29 
 
 
287 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  39.93 
 
 
287 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  42.05 
 
 
283 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  39.15 
 
 
287 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  38.85 
 
 
282 aa  201  1e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  37.96 
 
 
283 aa  201  1e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  42.31 
 
 
282 aa  200  2e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  38.27 
 
 
285 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  40.36 
 
 
295 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  38.04 
 
 
326 aa  198  8e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  41.29 
 
 
295 aa  197  1e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  40.54 
 
 
282 aa  197  2e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  37.55 
 
 
286 aa  197  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  40.54 
 
 
279 aa  197  2e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  4.76079e-06 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  36.69 
 
 
276 aa  197  2e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  40.93 
 
 
280 aa  196  5e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  39.38 
 
 
288 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  39.38 
 
 
285 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  39.38 
 
 
285 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  39.38 
 
 
285 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  40 
 
 
284 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  38.64 
 
 
296 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  39.42 
 
 
283 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  39.77 
 
 
285 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  39.77 
 
 
285 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  39 
 
 
285 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  39 
 
 
285 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.2557e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  40.54 
 
 
292 aa  191  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.29188e-06  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  39.38 
 
 
285 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  39.05 
 
 
283 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  38.22 
 
 
283 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  38.7 
 
 
284 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  38.61 
 
 
289 aa  190  3e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  39.38 
 
 
285 aa  190  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  38.61 
 
 
285 aa  188  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  37.5 
 
 
282 aa  188  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  8.58771e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  39 
 
 
285 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.2686e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  38.78 
 
 
275 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  38.78 
 
 
281 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  36.67 
 
 
296 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  38.78 
 
 
275 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  38.4 
 
 
297 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  38.4 
 
 
275 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  36.4 
 
 
283 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  37.84 
 
 
285 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  39.92 
 
 
281 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  37.31 
 
 
289 aa  182  5e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  36.6 
 
 
282 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.08028e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  36.23 
 
 
281 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  38.4 
 
 
280 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  38.01 
 
 
289 aa  180  3e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  36.02 
 
 
280 aa  180  3e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  37.16 
 
 
294 aa  179  3e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  37.12 
 
 
290 aa  179  6e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  36.99 
 
 
295 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  35.71 
 
 
379 aa  178  9e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  38.78 
 
 
283 aa  178  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  38.22 
 
 
284 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  36.1 
 
 
296 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  35.98 
 
 
279 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  37.45 
 
 
282 aa  175  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  36.68 
 
 
283 aa  174  1e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  35.05 
 
 
291 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  33.7 
 
 
328 aa  166  3e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  32.45 
 
 
300 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  36.19 
 
 
296 aa  162  5e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  36.19 
 
 
296 aa  162  5e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  34.56 
 
 
298 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 
284 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  33.21 
 
 
279 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  35.47 
 
 
298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.10603e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  35.47 
 
 
298 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  35.47 
 
 
298 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>