185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0063 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 
485 aa  1002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
497 aa  364  2e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
467 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
467 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
434 aa  314  2e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.9424e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
443 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
451 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
433 aa  305  1e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
451 aa  305  1e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  8.7846e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
445 aa  305  1e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
464 aa  304  2e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
458 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
457 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
456 aa  299  6e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
460 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  5.03575e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
462 aa  296  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
458 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
458 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
460 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
456 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
461 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
462 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.02075e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
462 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
473 aa  286  8e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
463 aa  285  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
466 aa  284  2e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
462 aa  284  3e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
462 aa  283  4e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
462 aa  283  6e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
462 aa  283  7e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
495 aa  282  8e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
463 aa  282  8e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
462 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
481 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
463 aa  280  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
463 aa  280  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0411  glycyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
476 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
574 aa  279  8e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
462 aa  279  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
574 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
607 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
575 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
445 aa  277  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
467 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
462 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
577 aa  275  1e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
581 aa  275  1e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
496 aa  274  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2067  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
456 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
463 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
471 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
466 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
460 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
594 aa  270  3e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  35.38 
 
 
506 aa  270  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  32.26 
 
 
461 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
502 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
589 aa  270  6e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
468 aa  270  6e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
630 aa  270  6e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
468 aa  270  6e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
509 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
574 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
494 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
579 aa  267  3e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
461 aa  267  3e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
490 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
448 aa  266  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
468 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
468 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
513 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
467 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
468 aa  266  6e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
557 aa  266  7e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01740  glycyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
511 aa  266  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
463 aa  266  7e-70  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0798  glycyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
465 aa  264  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.511892  normal  0.155631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
586 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
459 aa  262  9e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
460 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
593 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
459 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
504 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
461 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2058  glycyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
461 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
525 aa  260  4e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
488 aa  260  5e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
478 aa  259  5e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
515 aa  259  6e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
461 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.3951e-12 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
460 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
489 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.606258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>