More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0059 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 
260 aa  268  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.79 
 
 
254 aa  265  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 
248 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
254 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
254 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.79 
 
 
254 aa  258  8e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
254 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 
253 aa  249  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
251 aa  248  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 
251 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 
257 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 
257 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 
248 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.22 
 
 
259 aa  238  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.24 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.82 
 
 
258 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
244 aa  229  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.43 
 
 
261 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.49 
 
 
261 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.85 
 
 
258 aa  228  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 
261 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.4 
 
 
264 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
252 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 
252 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
272 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.92 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
626 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 
867 aa  218  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  43.37 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.24 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
262 aa  215  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  43.87 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 
610 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  42.17 
 
 
250 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.58 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
257 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.25 
 
 
271 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.06 
 
 
247 aa  209  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  40.57 
 
 
614 aa  209  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.04 
 
 
261 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.15 
 
 
262 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
272 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 
269 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
267 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.11 
 
 
264 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.46 
 
 
251 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.62 
 
 
252 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 
257 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 
626 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.3 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.3 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.3 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.3 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  44.21 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 
250 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  41.98 
 
 
240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.88 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.46 
 
 
242 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.88 
 
 
242 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
250 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.52 
 
 
266 aa  197  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.65 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  43.46 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.28 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  42.68 
 
 
241 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 
241 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
259 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.53 
 
 
257 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.34 
 
 
274 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
253 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.55 
 
 
255 aa  191  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
250 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 
250 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  42.26 
 
 
251 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 
269 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.37 
 
 
275 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
257 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>