42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0055 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0055  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1322  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0351  hypothetical protein  30.24 
 
 
680 aa  210  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0563  hypothetical protein  28.55 
 
 
686 aa  204  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.181416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  26.57 
 
 
663 aa  200  8e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1632  hypothetical protein  28.62 
 
 
680 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0566  hypothetical protein  28.92 
 
 
680 aa  198  2e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.415029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2189  Fibronectin-binding A domain protein  25.16 
 
 
708 aa  197  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0662  protein of unknown function DUF814  28.18 
 
 
589 aa  197  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2928  Fibronectin-binding A domain protein  26.03 
 
 
707 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0281  hypothetical protein  28.09 
 
 
680 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  2.38362e-05 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0157  hypothetical protein  28.55 
 
 
601 aa  187  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1177  protein of unknown function DUF814  28.88 
 
 
609 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1534  hypothetical protein  24.66 
 
 
641 aa  184  4e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0509  hypothetical protein  29.03 
 
 
613 aa  179  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1479  Fibronectin-binding A domain protein  23.78 
 
 
733 aa  173  8e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0866  Fibronectin-binding A domain protein  24.66 
 
 
727 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2853  Fibronectin-binding A domain protein  23.38 
 
 
723 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1592  hypothetical protein  25.97 
 
 
613 aa  166  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0175  hypothetical protein  26.07 
 
 
650 aa  165  2e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.432348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0936  hypothetical protein  24.23 
 
 
632 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0251474  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1780  hypothetical protein  24.82 
 
 
616 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  8.13258e-08 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0437  hypothetical protein  25.48 
 
 
627 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262278  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1566  protein of unknown function DUF814  24.26 
 
 
629 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.853541  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0745  hypothetical protein  23.93 
 
 
610 aa  157  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1330  hypothetical protein  24.3 
 
 
631 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.507535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1690  hypothetical protein  25.75 
 
 
614 aa  150  1e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  2.20008e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  27.9 
 
 
797 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0540  hypothetical protein  23.02 
 
 
642 aa  140  8e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0523546  normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42643  predicted protein  33.01 
 
 
1238 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10769  DUF814 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09170)  30.39 
 
 
1100 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0496389  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88476  predicted protein  25.52 
 
 
1069 aa  74.3  6e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289922  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32024  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  24.52 
 
 
1038 aa  70.1  1e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873906  normal  0.425602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1275  RNA-binding protein-like protein  21.49 
 
 
601 aa  65.5  3e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2041  Fibronectin-binding A domain protein  23.16 
 
 
532 aa  58.5  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.662273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0581  fibronectin-binding A-like protein  23.88 
 
 
588 aa  57.8  6e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1767  fibronectin-binding A domain-containing protein  23.94 
 
 
570 aa  55.8  3e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0286424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0857  fibronectin-binding A domain-containing protein  23.79 
 
 
525 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1314  Fibronectin-binding A domain protein  25.14 
 
 
594 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1812  Fibronectin-binding A domain protein  22.2 
 
 
568 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1691  fibronectin-binding A domain-containing protein  19.72 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1454  RNA-binding protein  20.99 
 
 
566 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.8196e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0351  putative fibronectin/fibrinogen-binding protein  26.21 
 
 
472 aa  44.7  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0710346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>