43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0054 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  257  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  43.7 
 
 
137 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  45.54 
 
 
147 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  40.71 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  39.67 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  35.29 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  39.58 
 
 
136 aa  82  2e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  41.84 
 
 
131 aa  82  2e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  3.77463e-05 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  78.2  3e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  78.2  3e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  38.78 
 
 
130 aa  78.6  3e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  78.2  3e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  41.84 
 
 
131 aa  76.6  1e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  34.51 
 
 
138 aa  76.6  1e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  39.8 
 
 
120 aa  70.5  8e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  35.9 
 
 
138 aa  68.6  3e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  32.79 
 
 
576 aa  66.2  1e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  36 
 
 
126 aa  65.1  3e-10  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  39 
 
 
142 aa  65.5  3e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  2.98888e-06  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  63.2  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  63.2  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  28 
 
 
580 aa  62.8  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  32.29 
 
 
154 aa  62.8  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  61.6  3e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  29.69 
 
 
155 aa  59.3  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  35.37 
 
 
652 aa  57.4  7e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  34.44 
 
 
118 aa  55.5  2e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  29.03 
 
 
116 aa  54.7  4e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  25.36 
 
 
580 aa  54.7  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  27.96 
 
 
580 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  28.12 
 
 
150 aa  52.4  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  30.77 
 
 
563 aa  50.1  9e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  29.35 
 
 
166 aa  47.8  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  27.83 
 
 
158 aa  47  9e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  25.41 
 
 
159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  25.41 
 
 
159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  27.08 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  27.08 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  26.04 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  29.1 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  27.08 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  22.22 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  2.24136e-05  normal  0.128546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>