278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0041 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  100 
 
 
307 aa  605  1e-172  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  42.41 
 
 
309 aa  218  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  38.68 
 
 
311 aa  197  2e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  38.21 
 
 
308 aa  192  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  41.33 
 
 
301 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  40.59 
 
 
301 aa  183  4e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  40.59 
 
 
301 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  38.08 
 
 
309 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  40.78 
 
 
302 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  37.59 
 
 
312 aa  175  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  38.11 
 
 
320 aa  174  1e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  34.55 
 
 
311 aa  173  4e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  36.7 
 
 
320 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  39.07 
 
 
320 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  36.49 
 
 
320 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  38.54 
 
 
296 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  36.58 
 
 
296 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  36.52 
 
 
311 aa  166  3e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  37.84 
 
 
320 aa  166  3e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  39.53 
 
 
291 aa  166  6e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  36.83 
 
 
320 aa  164  2e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  32.79 
 
 
301 aa  163  4e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.88911e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  34.98 
 
 
300 aa  163  4e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  39.58 
 
 
306 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  37.21 
 
 
320 aa  159  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  33.33 
 
 
325 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  37.87 
 
 
293 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  36.54 
 
 
293 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0054  homoserine kinase  37.58 
 
 
298 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  38.65 
 
 
291 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1078  homoserine kinase  36.79 
 
 
296 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  0.147957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  37.41 
 
 
311 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  37.38 
 
 
311 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  31.21 
 
 
311 aa  146  4e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  31.79 
 
 
300 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0972  homoserine kinase  37.71 
 
 
297 aa  139  4e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.779201  normal  0.0398229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  34.42 
 
 
308 aa  138  9e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  6.22844e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  33.79 
 
 
296 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  32.21 
 
 
315 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  32.53 
 
 
284 aa  134  2e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  29.57 
 
 
315 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  28.66 
 
 
304 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  32.2 
 
 
315 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  131  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  131  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  131  1e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  130  2e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  130  2e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  130  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  130  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  27.34 
 
 
310 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  28.96 
 
 
315 aa  131  2e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  27.34 
 
 
310 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.86 
 
 
315 aa  131  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  28.96 
 
 
315 aa  130  4e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  31.1 
 
 
322 aa  129  4e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  31.1 
 
 
322 aa  129  4e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  29.24 
 
 
315 aa  130  4e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  32.53 
 
 
302 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  31.21 
 
 
303 aa  129  9e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  33.33 
 
 
317 aa  129  9e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  28.33 
 
 
309 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  28.33 
 
 
309 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  28.81 
 
 
309 aa  128  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  28.33 
 
 
309 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  28.33 
 
 
309 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2720  homoserine kinase  31.88 
 
 
304 aa  128  1e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.699908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  28.81 
 
 
309 aa  128  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  28.81 
 
 
309 aa  128  1e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  28.33 
 
 
309 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  29.29 
 
 
309 aa  127  2e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  29.73 
 
 
323 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  29.59 
 
 
316 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  28.85 
 
 
323 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  29.24 
 
 
307 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.60344e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  30.68 
 
 
302 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  29.09 
 
 
331 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  30.34 
 
 
308 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  27.57 
 
 
305 aa  118  1e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  27.27 
 
 
307 aa  117  2e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  31 
 
 
303 aa  117  2e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  29.68 
 
 
313 aa  118  2e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  29.26 
 
 
318 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  27.57 
 
 
305 aa  116  4e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  28.41 
 
 
306 aa  116  4e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  27.48 
 
 
309 aa  116  4e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  33.11 
 
 
307 aa  116  4e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  34.42 
 
 
314 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  27.94 
 
 
311 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  3.32858e-09 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  27.34 
 
 
309 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  27.3 
 
 
309 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  27.68 
 
 
309 aa  114  2e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  30.48 
 
 
303 aa  114  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  31.39 
 
 
315 aa  114  2e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  28.47 
 
 
318 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  27.27 
 
 
314 aa  113  4e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  3.01538e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  26.71 
 
 
314 aa  113  4e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  28.43 
 
 
328 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  29.68 
 
 
300 aa  112  7e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  28.99 
 
 
304 aa  112  8e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>