290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0040 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0040  ExsB family protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1856  ExsB family protein  36.59 
 
 
276 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1266  ExsB family protein  36.18 
 
 
275 aa  148  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.332484  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2106  ExsB family protein  34.96 
 
 
266 aa  147  2e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.060308  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0202  ExsB family protein  35.77 
 
 
270 aa  139  5e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  37.39 
 
 
232 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  38.64 
 
 
484 aa  135  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  36.56 
 
 
221 aa  134  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  35.65 
 
 
229 aa  133  2e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  35.81 
 
 
223 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  34.96 
 
 
243 aa  132  4e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  37.33 
 
 
216 aa  131  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  37.44 
 
 
217 aa  131  7e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  33.33 
 
 
251 aa  130  1e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  35.81 
 
 
219 aa  131  1e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  36.24 
 
 
218 aa  130  1e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  36.56 
 
 
221 aa  130  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  35.05 
 
 
222 aa  129  5e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.18958e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  34.78 
 
 
219 aa  129  5e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  34.33 
 
 
246 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  34.65 
 
 
222 aa  127  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  32.75 
 
 
226 aa  126  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  33.04 
 
 
224 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  33.48 
 
 
224 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  34.19 
 
 
229 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  33.33 
 
 
227 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  36.21 
 
 
228 aa  125  4e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  33.76 
 
 
234 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  36.21 
 
 
228 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  34.35 
 
 
224 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  35.37 
 
 
230 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  35.34 
 
 
223 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  35.24 
 
 
218 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  32.33 
 
 
221 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  32.75 
 
 
227 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  33.19 
 
 
228 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  35.65 
 
 
229 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  35.22 
 
 
226 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  33.91 
 
 
225 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  31.88 
 
 
224 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  35.5 
 
 
232 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  33.93 
 
 
221 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  35.22 
 
 
224 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  35.37 
 
 
237 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  34.36 
 
 
218 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  34.48 
 
 
228 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  34.93 
 
 
228 aa  120  1e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  34.93 
 
 
224 aa  121  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  33.19 
 
 
233 aa  120  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  34.5 
 
 
224 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  34.2 
 
 
235 aa  120  2e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  34.03 
 
 
256 aa  120  2e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  33.77 
 
 
225 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  34.35 
 
 
224 aa  119  5e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  34.5 
 
 
224 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  35.06 
 
 
226 aa  118  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  34.48 
 
 
225 aa  118  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  34.35 
 
 
224 aa  117  1e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  33.19 
 
 
233 aa  117  1e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  33.77 
 
 
224 aa  117  1e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  35.27 
 
 
227 aa  117  1e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  34.53 
 
 
231 aa  116  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  34.06 
 
 
233 aa  117  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  34.51 
 
 
222 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  35.27 
 
 
232 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  33.04 
 
 
220 aa  115  4e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  33.62 
 
 
225 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  35.53 
 
 
232 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  34.63 
 
 
244 aa  115  7e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  34.91 
 
 
240 aa  115  8e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
230 aa  115  8e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  34.91 
 
 
240 aa  115  8e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  34.91 
 
 
240 aa  115  8e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  31.6 
 
 
227 aa  114  1e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  34.91 
 
 
240 aa  114  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3257  queuosine biosynthesis protein QueC  35.16 
 
 
231 aa  114  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  34.91 
 
 
240 aa  114  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  34.53 
 
 
232 aa  114  1e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1102  queuosine biosynthesis protein QueC  35.43 
 
 
232 aa  114  1e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232921  hitchhiker  2.30205e-06 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  31.2 
 
 
251 aa  114  2e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  31.98 
 
 
229 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  33.33 
 
 
259 aa  113  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  35.94 
 
 
245 aa  114  2e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  32.62 
 
 
222 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  33.2 
 
 
234 aa  112  4e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  35.16 
 
 
231 aa  112  4e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  33.04 
 
 
236 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  33.18 
 
 
224 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  33.88 
 
 
233 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  33.77 
 
 
232 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  34.53 
 
 
230 aa  111  7e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  34.2 
 
 
257 aa  111  7e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  33.61 
 
 
233 aa  111  7e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  31.62 
 
 
243 aa  111  7e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  35.53 
 
 
235 aa  112  7e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  33.63 
 
 
237 aa  111  8e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  34.22 
 
 
236 aa  111  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  33.77 
 
 
221 aa  111  1e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  29.74 
 
 
230 aa  110  1e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  33.64 
 
 
233 aa  110  1e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>