More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0038 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0038  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
185 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.39263e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  48.65 
 
 
185 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  48.37 
 
 
190 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 
187 aa  179  3e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  49.72 
 
 
198 aa  179  3e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 
198 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 
207 aa  177  6e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 
192 aa  175  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 
195 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 
188 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.76289e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 
200 aa  174  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
206 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 
220 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  48.13 
 
 
198 aa  173  1e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  45.65 
 
 
187 aa  172  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 
195 aa  172  2e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 
189 aa  172  2e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
219 aa  172  2e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 
206 aa  171  4e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
257 aa  171  4e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 
209 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  51.41 
 
 
202 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 
189 aa  169  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 
185 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 
214 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 
216 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  48.4 
 
 
210 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  45.21 
 
 
189 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  48.85 
 
 
195 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  49.73 
 
 
217 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  45.21 
 
 
189 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 
194 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 
185 aa  168  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  45.65 
 
 
188 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  45.99 
 
 
222 aa  167  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 
188 aa  167  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 
214 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  45.16 
 
 
186 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 
234 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 
214 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 
227 aa  165  3e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  46.59 
 
 
213 aa  165  3e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  45.7 
 
 
202 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1879  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 
184 aa  164  6e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.01387e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 
202 aa  164  6e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  45.81 
 
 
199 aa  164  7e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  48.59 
 
 
201 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  45.99 
 
 
219 aa  164  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  46.02 
 
 
213 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  48.59 
 
 
201 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  48.59 
 
 
201 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  45.25 
 
 
187 aa  164  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  46.41 
 
 
218 aa  163  1e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  46.96 
 
 
199 aa  163  1e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 
219 aa  162  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 
205 aa  162  2e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  45.6 
 
 
213 aa  162  2e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  44.92 
 
 
207 aa  162  2e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 
193 aa  162  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  45.16 
 
 
219 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  44.75 
 
 
188 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.14147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  44.81 
 
 
199 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  42.39 
 
 
188 aa  162  4e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 
205 aa  161  4e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  44.26 
 
 
206 aa  162  4e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  45.14 
 
 
202 aa  161  5e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 
179 aa  161  5e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 
188 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 
220 aa  161  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 
200 aa  160  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  44.68 
 
 
216 aa  160  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  50.65 
 
 
202 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 
190 aa  160  8e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  43.85 
 
 
235 aa  160  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  46.63 
 
 
269 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 
187 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.28412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  49.04 
 
 
201 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 
235 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  46.63 
 
 
269 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  45.41 
 
 
201 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 
190 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 
190 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  44.97 
 
 
247 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 
199 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  42.47 
 
 
214 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  46.2 
 
 
182 aa  159  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  47.02 
 
 
195 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  45.81 
 
 
272 aa  158  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  45.11 
 
 
212 aa  158  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 
225 aa  157  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  44.91 
 
 
185 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  44.21 
 
 
235 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  45.51 
 
 
269 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  42.54 
 
 
190 aa  157  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  42.47 
 
 
239 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  42.47 
 
 
239 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  49.68 
 
 
205 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  44.86 
 
 
243 aa  157  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  42.54 
 
 
193 aa  157  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>