15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0034 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  674  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  40.32 
 
 
303 aa  56.6  6e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 
114 aa  52  1e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 
118 aa  50.8  3e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 
116 aa  49.7  6e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
313 aa  49.3  9e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  34.43 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  24.79 
 
 
172 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  33.87 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  33.9 
 
 
117 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  27.17 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1741  hypothetical protein  26.03 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  36 
 
 
274 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>