More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0026 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
252 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
257 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
282 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
248 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
252 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.13 
 
 
249 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.27 
 
 
256 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  6.02932e-10 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
253 aa  182  4e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  182  5e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 
248 aa  179  3e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
250 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
262 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
252 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  40.71 
 
 
254 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
256 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.32 
 
 
247 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
262 aa  174  1e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
244 aa  173  3e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
254 aa  173  3e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
254 aa  172  4e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
253 aa  172  4e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
254 aa  172  6e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 
246 aa  172  6e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
246 aa  172  7e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
249 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
252 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
253 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
253 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 
246 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
251 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.25 
 
 
266 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
251 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
248 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  40.16 
 
 
265 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.26 
 
 
254 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
253 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.36 
 
 
249 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
251 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
253 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 
252 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
253 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
264 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
253 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
257 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
254 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
262 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
255 aa  166  3e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
264 aa  166  3e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 
246 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
255 aa  166  3e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
248 aa  166  3e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
253 aa  166  3e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
255 aa  166  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
256 aa  166  3e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
261 aa  166  3e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
255 aa  166  3e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
255 aa  166  3e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.63 
 
 
248 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.10753e-06  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
256 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2396  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.63 
 
 
248 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.42518e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.63 
 
 
248 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.20967e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.63 
 
 
248 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
246 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
247 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17117e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
246 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
254 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
258 aa  165  6e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
253 aa  165  7e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.15 
 
 
248 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.2608e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
260 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
249 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
254 aa  164  1e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  164  1e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
251 aa  164  1e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
253 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
256 aa  164  1e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
261 aa  164  1e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
249 aa  164  1e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.80764e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  39.02 
 
 
245 aa  164  1e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.87281e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
251 aa  164  1e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1759  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
248 aa  164  2e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.35211e-08  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1980  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 
248 aa  164  2e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  8.30224e-08  decreased coverage  0.000580002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
246 aa  163  2e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1719  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
248 aa  164  2e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.31365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
248 aa  163  2e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.01343e-08  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
245 aa  163  2e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2573  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
248 aa  164  2e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.59991e-07  hitchhiker  0.00324451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
248 aa  164  2e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.69264e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
271 aa  163  2e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
245 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  40 
 
 
255 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.80405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
248 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.19104e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
272 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1582  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
248 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
260 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
257 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>